实验室表型成像系统——LAB SCANALYZER
日期:2018-02-02 13:14:44

实验室表型成像系统LAB SCANALYZER

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Lab Scanalyzer 顶部成像版本(左框:柜式版本;右框:台式版本)



实验室植物表型成像系统——Lab ScanalyzerScanalyzer系列中的一个版本,可进行可见光(VIS)成像。摄像头固定,没有传送装置,通过手工更换样品,测量较小的样品。Lab Scanalyzer有两个不同版本,一个版本为顶部成像版本,另一个为顶部及侧面成像版本。其中顶部成像版本分为柜式和台式两种,以用于不同高度植物的表型研究。可对小盆植株、用多孔板培养的植物、多孔板里的叶圆片、植物的种子,也可以对细菌、小型动物、虫卵等进行表型成像测量,进行各种研究。

实验室表型成像系统Lab Scanalyzer是一个多功能的成像柜,设计用于植物和小型生物体的低成本表型分析。在标准配置中,一个RGB传感器与照明系统一起安装在机柜的顶部(底部照明可供选用)成像机柜有立柜式与台式两种规格。Lab Scanalyzer适用于表型测试,如生长研究、测试对压力和环境因素的表型反应、萌发测定或生态毒理学测试。系统提供形态测量参数的测量,包括:叶面积、叶周长、偏心率、圆度;、圆直径、中等叶宽指数、密实度、凸面区域面积、质心等参数。软件可以从RGB相机或任何CCD或高光谱相机的照片或视频中测量叶片大小或莲座叶直径。


实验室成像系统Lab Scanalyzer RGB成像还可以完成:

Ø  植物适应性评估中的颜色分割

Ø  计算叶片生长相对速率

Ø  整个实验期间叶面积差异的比较

Ø  绿化指数

Ø  颜色分割后的各种颜色对表征的贡献


除了上面提到的标准配置,Lab Scanalyzer也新增了顶视-侧视版本。该版本特别用于高达40cm盆栽植物(盆直径40cm)表型成像,包含一个自上而下的镜头和一个水平镜头,可以从各个方面拍摄样品图像。

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主要功能

l  对植物等小型样品进行可见光顶部成像或顶部+侧面成像

l  通过可见光成像可以测量植物的结构、宽度、密度、对称性、叶长、叶宽、叶面积、叶颜色、

叶病斑、种子颜色、种子颜色面积等多个参数

l  可适用 96 孔板高精度测量     

l  进行动物/昆虫的游动/运动测试时,可自动获取图像

应用领域

植物生理学、农业科学、植物病理学、遗传育种、突变株筛选、植物形态建模、种子生理学、种子病理学、植物胁迫生理学、植物水力学、毒理学等研究领域。


技术规格

样本类型

·                       在盆或小盘子的植物,例如拟南芥、小型水稻、花卉等

·                       在多孔板或培养皿中的样品,例如种子、叶片、浮萍、幼虫等

·                       植物部分组织,例如叶子,果实等

成像

可见光顶部成像或可见光顶部+侧面成像

8百万像素,35mm镜头,29°/ 21°视角;

照明

顶部或底部或顶部和侧面

外形尺寸

台式版本:600 mm x 600 mm x 1128.5 mm

立柜式版本:600 mm x 600 mm x 1750 mm

顶视-侧视版本:2059 mm x 660 mm x 1290 mm

内部空间

台式版本:约410mm×480mm的样本成像面积(底部距相机550mm的距离)

立柜式版本:约410mm×480mm的样本面积底部距相机1100毫米的距离

顶视-侧视版本:约450mmx 450mm(距顶部摄像头1000mm,侧面摄像头距离1200mm

重量

台式版本:60kg;立柜式版本:100kg;顶视-侧视版本:200kg

控制

带触摸面板的集成式PC(顶视版本)或专用PC(用于顶视-侧视版本)

软件

过程控制,图像采集,数据导出,数据处理


软件功能

LemnaTec OS是一个用于植物,种子和小型生物体表型分析的完整软件系统。 一套集成模块可自动完成表型分型过程并分析所得图像。 LemnaTec OS提供API来集成第三方白菜网送彩金2018,包括传感器,传送带,照明系统和软件。 复杂的程序可以快速简便地自动执行,并且系统能够处理大量的图像和数据。

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  • 控制植物盆栽和传感器的移动

  • 计划并执行浇水,喷淋和成像的程序

  • 用于集成各种传感器的API

  • 用于非LemnaTec设备的可编程接口

  • 集中数据采集

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  • 用于详细图像分析与处理

  • 广泛的图像格式

  • 图像处理算法库,包括高光谱数据

  • 用于集成第三方图像处理软件的API

LEMNA-R

  • 通过plotting功能轻松访问所有数据

  • R语言无缝集成

  • 可配置的数据处理功能

  • 数据和图像的可视化

  • 报告生成器

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  • 服务器或PC上的数据库管理

  • 具有完整文档的开放数据库访问权限

  • 图像,数据和分析的图形显示

  • 植物和传感器的位置数据

 

应用实例

u  拟南芥形态学分析


通过对拟南芥的可见光成像,可以分析各种形态学参数。



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对称性分析

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紧密性(Compactness)分析


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直径测量





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最大叶长


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叶片 Center of Mass


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可视化二阶距(Second moments visualization)



u  种子真菌感染分析

即使利用基础型成像系统 Lab Scanalyer也可以对种子进行高通量分析,获得详细的形态、颜色信息,进行生理、病理诊断。如下图就是对通过成像分析麦粒的真菌感染情况

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